RESUMO
Emerging pathogens can have devastating effects on naïve hosts, but disease outcomes often vary among host species. Comparing the cellular response of different hosts to infection can provide insight into mechanisms of host defence. Here, we used RNA-seq to characterize the transcriptomic response of Darwin's finches to avian poxvirus, a disease of concern in the Galápagos Islands. We tested whether gene expression differs between infected and uninfected birds, and whether transcriptomic differences were related either to known antiviral mechanisms and/or the co-option of the host cellular environment by the virus. We compared two species, the medium ground finch (Geospiza fortis) and the vegetarian finch (Platyspiza crassirostris), to determine whether endemic Galápagos species differ in their response to pox. We found that medium ground finches had a strong transcriptomic response to infection, upregulating genes involved in the innate immune response including interferon production, inflammation, and other immune signalling pathways. In contrast, vegetarian finches had a more limited response, and some changes in this species were consistent with viral manipulation of the host's cellular function and metabolism. Many of the transcriptomic changes mirrored responses documented in model and in vitro studies of poxviruses. Our results thus indicate that many pathways of host defence against poxviruses are conserved among vertebrates and present even in hosts without a long evolutionary history with the virus. At the same time, the differences we observed between closely related species suggests that some endemic species of Galápagos finch could be more susceptible to avian pox than others.
Resumen Los patógenos emergentes pueden generar efectos devastadores en huéspedes nuevos, sin embargo, los efectos de la enfermedad varían según el tipo de huésped. Al comparar la respuesta celular de las diferentes especies afectadas se puede determinar el mecanismo de defensa del huésped, y la base de susceptibilidad a la enfermedad. A través de la secuenciación de ARN, se caracterizó la respuesta de transcripción de viruela aviar, un virus introducido, en los pinzones de Darwin. Probamos si una expresión genética difiere entre aves infectadas y no infectadas, y si la diferencia de transcripción estaba relacionada con mecanismos antivirales conocidos y/o con la co-opción del entorno celular del hospedero por parte del virus. Comparamos dos especies, pinzón mediano de tierra (Geospiza fortis) y pinzón vegetariano (Platyspiza crassirostris), para determinar si estas especies tienen variación en sus respuestas al mismo patógeno nuevo. Encontramos que el pinzón mediano de tierra presenta una fuerte respuesta de transcripción a la infección, involucrando a la regulación de genes inmunes que incluyen la producción de interferón, inflamación y otras vías de respuesta inmunológica. A diferencia del pinzón vegetariano que presenta una respuesta más limitada a la infección. Nuestros resultados revelaron evidencia de manipulación viral en la función celular del hospedador y en el metabolismo del huésped, proporcionando información sobre como la viruela aviar afecta al huésped. Varias de las respuestas de transcripción a la infección se ven reflejadas en estudios in vitro y en modelos animales, lo cual indica que muchas vías de defensa del huésped contra la viruela son conservadas en vertebrados incluso en huéspedes sin una historia evolutiva larga del virus. Al mismo tiempo, la variación que observamos entre especies estrechamente relacionadas indica que algunas especies endémicas de pinzones de Galápagos podrían ser más susceptibles a la viruela aviar que otras especies.
